Putins besök i den syriska huvudstaden var hans första sedan kriget i Syrien bröt ut för snart nio år sedan, rapporterar AFP.
Den syriska armén kämpade länge ensamma mot väststödda islamistiska terroristgrupper och rebeller men har sedan 2015 Rysslands militär på sin sida.
Enligt en talesman för Kreml uttryckte al-Assad sin tacksamhet till Ryssland för hjälpen i kampen mot terrorismen och med att återställa fred och trygghet i fler delar av landet.
Putin påpekade å sin sidan vilka stora framsteg som gjorts för att återställa Syriens suveränitet och territoriella integritet.